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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

台媒：台海巡部门首艘最大吨位嘉义舰进港失控，疑风浪大撞码头受损******

　　【环球网报道】据台湾中时新闻网30日报道，台“海巡署”舰队分署中部机动海巡队4000吨级嘉义舰，大年初三(24日)进入台中港时，疑因风浪太大失控撞上码头，嘉义舰右侧舷边外板有擦痕，码头轮档也被撞损坏，无人伤亡。报道称，台中港务分公司30日接获专用码头承租业者台电公司通报，将向“海巡署”索赔，并要求修复被撞坏的码头，至于肇事原因，正由航港局中部航务中心海事调查。

　　据报道，航港局中部航务中心表示，这起意外发生在24日上午8时许，4000吨级嘉义舰进入台中港准备靠泊海巡专用码头时，突然疑因东北季风强劲造成失控，右侧船舷擦撞5B码头，码头轮档边缘被撞损坏，嘉义舰右侧舷边外板也有擦痕。

　　台中港务分公司30日下午联系专用码头承租业者台电公司称，经检视码头设施后，发现码头岸肩水泥破损，无漏油污染的情况。港务公司港务处将于31日下午14时邀肇事的“海巡署”中部机动海巡队、台电公司、中部航务中心、港务公司维管处及业务处共同派员进行现场勘查，确认设施损失及后续修护事宜。

　　据中时新闻网报道，“海巡署”首艘最大吨位4000吨级嘉义舰于2021年7月进驻台中港，舰长125米、宽16.5米、最大吃水4.7米，舰上还配备2.75吋火箭炮1门、20机炮等武器系统，舰艉有29米的直升机甲板，可供台海军S170C直升机或空勤总队黑鹰直升机“驻舰”执勤，主要负责台湾海峡侦巡任务。(环球网)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）